More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2450 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  439  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  32.62 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  21.89 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3035  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  26.83 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 185 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 324 aa  55.8  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 185 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  27.55 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  26.05 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  23.16 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 208 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 185 aa  50.8  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0267  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.614895  hitchhiker  0.00323328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  31.9 
 
 		 230 aa  50.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1320  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 196 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3453  transcriptional regulator TetR family  28.36 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0743  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 230 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.803231 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  42.86 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 202 aa  49.7  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0212  transcription regulator TetR/AcrR family protein  43.4 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0180  TetR/AcrR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0296493  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0183  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 335 aa  48.9  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0389  transcriptional regulator, TetR family  56.41 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.245239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0194  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4097  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2735  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2741  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1382  transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  36.71 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  29.7 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2216  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191802  normal  0.0189795 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  38.1 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  29.67 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1327  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.15266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 206 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0148  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3063  regulatory protein TetR  47.73 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 210 aa  46.6  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19500  transcriptional regulator, tetR family  37.93 
 
 		 181 aa  46.2  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.64021  normal  1 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 291 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  35.94 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>