More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1265 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1265  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01975  hypothetical protein  40.93 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.10817  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  104  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 219 aa  95.5  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 204 aa  87.4  1e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 223 aa  84  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 203 aa  79.7  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1436  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 206 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.940915  normal  0.193535 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  31.93 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  24.57 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  25.66 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  21.88 
 
 		 264 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  36.79 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  24.03 
 
 		 255 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  21.82 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 273 aa  51.6  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1166  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.522591  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1993  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.209055  normal  0.134866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.29 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3063  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.857011  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  23.72 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4446  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3058  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.765793  normal  0.0466418 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 198 aa  50.1  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1000  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6292  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5116  TetR family transcriptional regulator  19.02 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2468  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0532  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 424 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0092  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00302716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5637  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.766944 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8103  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  31.82 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  20 
 
 		 390 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3598  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 222 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.822043 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 324 aa  48.9  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  23.12 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3303  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.916403  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  23.02 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  27.03 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.72 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6530  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.051486 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 219 aa  48.1  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 438 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 211 aa  48.1  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  23.95 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 228 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3943  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.938406  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 184 aa  47.8  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  20.83 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5264  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 470 aa  47.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.641699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1008  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 238 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  22.42 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1080  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2295  TetR family transcriptional regulator  18.87 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2179  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.905523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  21 
 
 		 241 aa  47.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  20.25 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 244 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 424 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0991  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 238 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  34.04 
 
 		 400 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0472  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.010781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>