More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3474 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  100 
 
 		 191 aa  399  9.999999999999999e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  37.77 
 
 		 193 aa  119  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  37.77 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 199 aa  104  7e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 192 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 203 aa  94.7  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 203 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 198 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 202 aa  92  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 188 aa  91.3  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 213 aa  90.5  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 194 aa  87  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 188 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 189 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 215 aa  77.8  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 192 aa  73.2  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 201 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 203 aa  67.4  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 193 aa  63.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  22.95 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 234 aa  56.6  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  33.66 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  25.69 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  43.1 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 324 aa  55.1  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1982  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 209 aa  54.3  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.142001  hitchhiker  0.0000322137 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  47.17 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
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NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 247 aa  53.1  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
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NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
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NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
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