More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1288 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  446  1.0000000000000001e-124  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 203 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  38.42 
 
 		 192 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 192 aa  148  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  41.78 
 
 		 190 aa  122  5e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 202 aa  122  5e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 196 aa  121  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 200 aa  121  7e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 202 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  40.41 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 190 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 194 aa  115  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 190 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  36.99 
 
 		 206 aa  105  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  38.61 
 
 		 205 aa  99.8  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 203 aa  92.8  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 190 aa  89.4  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 191 aa  87  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
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NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
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NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 189 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 195 aa  83.2  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 190 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 193 aa  81.3  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  29.21 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 195 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 192 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 188 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 188 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 187 aa  72.8  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 191 aa  72.4  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 202 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  27.81 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 192 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 203 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 190 aa  66.2  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 220 aa  61.6  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2156  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.362049 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  21.88 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 288 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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