More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2554 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
198 aa  413  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  62.37 
 
 
193 aa  256  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  61.29 
 
 
194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  52.69 
 
 
199 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
203 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
188 aa  125  5e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 
188 aa  121  6e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
198 aa  106  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
213 aa  104  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  31.94 
 
 
191 aa  95.9  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
190 aa  95.9  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
189 aa  95.5  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 
190 aa  94.4  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
192 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 
203 aa  89.4  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 
191 aa  89  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 
194 aa  87.8  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
191 aa  79  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
190 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 
186 aa  70.5  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 
192 aa  63.9  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 
191 aa  61.6  0.000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 
188 aa  60.8  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 
188 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 
188 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
191 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
194 aa  58.9  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
202 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 
216 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 
200 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 
195 aa  57  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 
188 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  32 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 
213 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  28.76 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 
200 aa  55.8  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 
205 aa  55.1  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 
185 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
214 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  26.98 
 
 
193 aa  55.1  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 
211 aa  54.7  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 
189 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 
183 aa  54.7  0.0000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  26.12 
 
 
173 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 
191 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 
184 aa  54.3  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
215 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0275989 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 
194 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 
241 aa  53.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
209 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 
190 aa  53.1  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.18 
 
 
190 aa  52.8  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 
224 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  24.7 
 
 
198 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 
196 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.06 
 
 
201 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 
201 aa  52.8  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
205 aa  52.4  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 
242 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 
205 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 
218 aa  52.4  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  30.53 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 
195 aa  52  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
211 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
195 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 
196 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0369519 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 
195 aa  52  0.000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 
193 aa  52  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 
208 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
185 aa  51.6  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 
197 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
185 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
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NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 
190 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
215 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal 
 
 
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NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
201 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
220 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  29.21 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
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