More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1236 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 215 aa  121  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 197 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 203 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 191 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  35.22 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 194 aa  103  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 190 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 190 aa  102  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 201 aa  101  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  37.41 
 
 		 202 aa  101  7e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 200 aa  101  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 194 aa  99.8  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  35.9 
 
 		 206 aa  98.2  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 202 aa  98.2  7e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 190 aa  91.3  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 190 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 186 aa  82.8  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 194 aa  78.6  0.00000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 191 aa  72  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 191 aa  72  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 191 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 192 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 190 aa  68.2  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  24.59 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  23.63 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 196 aa  64.3  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  27.85 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 		 192 aa  62  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  28.3 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2228  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112072 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 204 aa  58.2  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  34.67 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  22.37 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  23.27 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 497 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>