More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3522 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  420  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  74.24 
 
 		 198 aa  312  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  35.83 
 
 		 190 aa  118  7e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  111  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 194 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 208 aa  88.2  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 193 aa  87.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  30.37 
 
 		 193 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 204 aa  62  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
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NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 310 aa  53.9  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
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NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_2337  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.784236 
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
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NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 193 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
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NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  52.8  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
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NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
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NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 181 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
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NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
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NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  41.38 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
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NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  22.54 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 		 190 aa  51.2  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc0162  transcription regulator protein  35.48 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.1146  normal  0.445023 
 
 
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NC_012669  Bcav_0654  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  29.17 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
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NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
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NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  48.9  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
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NC_013165  Shel_28270  transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.188874 
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  48.94 
 
 		 196 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  46 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
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NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  46 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
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