281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4747 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
192 aa  381  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  98.96 
 
 
192 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  85.94 
 
 
192 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  85.94 
 
 
192 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  85.94 
 
 
192 aa  314  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  85.94 
 
 
192 aa  313  7e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  53.76 
 
 
190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  53.76 
 
 
190 aa  191  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
193 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
193 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 
193 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  44.74 
 
 
193 aa  149  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  45.21 
 
 
196 aa  148  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1459  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 
187 aa  136  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 
191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 
183 aa  107  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
187 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
193 aa  82  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 
190 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  29.59 
 
 
206 aa  77  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 
191 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
192 aa  75.9  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
202 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 
205 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
192 aa  73.2  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 
215 aa  73.2  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
190 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
197 aa  71.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 
194 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  36.27 
 
 
194 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 
194 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 
189 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
192 aa  65.1  0.0000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 
201 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 
194 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 
190 aa  62.4  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  32.38 
 
 
203 aa  58.5  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
186 aa  55.1  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 
194 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
188 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
188 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
195 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
191 aa  54.3  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
188 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 
188 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  34.04 
 
 
193 aa  53.9  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
222 aa  52.4  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  25.36 
 
 
203 aa  52.4  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2624  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 
210 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.465145  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 
193 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
194 aa  51.2  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
244 aa  51.2  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 
199 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 
198 aa  50.4  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5134  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
198 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 
234 aa  49.7  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5223  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 
210 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5515  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.674737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 
182 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  41.07 
 
 
224 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 
193 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 
194 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
190 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
190 aa  48.5  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  32.53 
 
 
194 aa  48.5  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  48.28 
 
 
204 aa  48.5  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
218 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
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NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 
190 aa  48.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 
188 aa  48.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008025  Dgeo_2120  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 
195 aa  47.8  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012669  Bcav_4064  regulatory protein TetR  37.21 
 
 
190 aa  47.8  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.3318 
 
 
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NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 
199 aa  47.8  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.899046 
 
 
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NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  25.69 
 
 
210 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
228 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 
199 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 
204 aa  47  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_5811  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 
222 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.78864  normal 
 
 
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NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  24.29 
 
 
193 aa  47  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
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NC_013235  Namu_0808  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 
222 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
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