More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3436 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  401  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  63.4 
 
 		 192 aa  265  2.9999999999999995e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  60.31 
 
 		 191 aa  251  6e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 203 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  56.19 
 
 		 191 aa  234  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  52.06 
 
 		 190 aa  214  9e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  52.06 
 
 		 190 aa  211  3.9999999999999995e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  49.74 
 
 		 189 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 186 aa  155  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  34.57 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  32.46 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 188 aa  89.4  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 198 aa  87.8  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 192 aa  87  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 197 aa  87  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  31.79 
 
 		 191 aa  87  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 192 aa  85.9  4e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 190 aa  82  0.000000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 190 aa  80.1  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 202 aa  79  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 196 aa  78.6  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 191 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 195 aa  75.9  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  27.61 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  24.35 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 202 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 194 aa  73.9  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  28.65 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  26.57 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0243  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4864  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.935636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5456  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5406  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313854  normal  0.0102978 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4747  TetR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.931681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 324 aa  63.2  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5292  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.505597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  26.22 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.25 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1527  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 185 aa  56.2  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.718491  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  24.42 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 248 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5718  putative transcriptional regulator  35.9 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 258 aa  53.1  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  22.96 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 240 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>