More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3500 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  75.39 
 
 		 203 aa  308  4e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  72.77 
 
 		 191 aa  301  4.0000000000000003e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  71.35 
 
 		 192 aa  297  6e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  60.31 
 
 		 194 aa  251  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  62.3 
 
 		 190 aa  247  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  61.78 
 
 		 190 aa  241  3.9999999999999997e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  54.74 
 
 		 189 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 186 aa  157  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  32.98 
 
 		 193 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  32.99 
 
 		 191 aa  97.8  7e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 188 aa  94.7  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 197 aa  92.8  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 190 aa  92  4e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 188 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 188 aa  90.5  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 198 aa  89  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 215 aa  89  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 192 aa  88.6  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  31.05 
 
 		 194 aa  87.8  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 203 aa  84.7  7e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 203 aa  80.9  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 188 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 193 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3254  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 201 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 190 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 194 aa  71.2  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0191  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 191 aa  69.7  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3455  regulatory protein TetR  25.31 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.336833  normal  0.0784455 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 202 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 187 aa  64.7  0.0000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  48.57 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 248 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 240 aa  62  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 248 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 248 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  25 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
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NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
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NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
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NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  27.97 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
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