141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2309 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  394  1e-109  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0730  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 200 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000193069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  35.14 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 235 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  30.63 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  37.97 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 253 aa  52.8  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 252 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 252 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 244 aa  52.4  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 252 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 251 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 239 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 238 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 192 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  20.94 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 215 aa  48.5  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 242 aa  48.1  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 192 aa  48.1  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 215 aa  47.8  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 220 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 219 aa  47  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  18.72 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  29.91 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  18.69 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  23.62 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  41.18 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  35.29 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 198 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 204 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 206 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 236 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 208 aa  44.7  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  24.07 
 
 		 202 aa  44.7  0.0009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 230 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  21.65 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  17.46 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  24.17 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>