More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5122 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_5122  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 240 aa  486  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.243003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4589  TetR family transcriptional regulator  98.33 
 
 		 248 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.954889 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5031  TetR family transcriptional regulator  94.98 
 
 		 248 aa  463  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3126  TetR family transcriptional regulator  95.82 
 
 		 248 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.068587  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5241  TetR family transcriptional regulator  95.82 
 
 		 248 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.927318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0422  TetR family transcriptional regulator  93.19 
 
 		 248 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3465  TetR family transcriptional regulator  91.45 
 
 		 248 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.980317  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0801  TetR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0472  TetR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1609  TetR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1961  TetR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.140222  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0543  TetR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.387034  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0655  TetR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.64003  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2057  TetR family transcriptional regulator  86.25 
 
 		 254 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.649855  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0946  TetR family transcriptional regulator  86.55 
 
 		 258 aa  419  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.806854  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3563  TetR family transcriptional regulator  70.82 
 
 		 254 aa  349  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.473219 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4685  transcriptional regulator, TetR family  70.51 
 
 		 259 aa  339  2e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0466377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0959  TetR family transcriptional regulator  69.17 
 
 		 248 aa  336  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0776064  normal  0.539269 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3361  TetR family transcriptional regulator  63.68 
 
 		 238 aa  291  4e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.752589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 234 aa  280  1e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1468  TetR family transcriptional regulator  59.28 
 
 		 260 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  53.98 
 
 		 234 aa  259  3e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0611  TetR family transcriptional regulator  56.39 
 
 		 248 aa  254  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 196 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 196 aa  70.1  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  24.51 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  24.22 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 188 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 195 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 195 aa  66.6  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  23.28 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 191 aa  62  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3720  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  20.77 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 224 aa  60.8  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 226 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4589  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.447268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  21.81 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 208 aa  57  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  21.93 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  38.67 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0318  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.701446 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  22.77 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1551  transcription regulator protein  32.89 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.000000200418  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 		 214 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 266 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1297  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.843552  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6140  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.943652 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6533  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>