More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1053 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  83.94 
 
 		 195 aa  341  4e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  75.92 
 
 		 194 aa  308  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 191 aa  84.7  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  71.6  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 191 aa  68.6  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 186 aa  67  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  54.24 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 195 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  42.57 
 
 		 222 aa  65.1  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  29.19 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 195 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 195 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 299 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 198 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  44.44 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  24.16 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  23.59 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
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NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35360  transcriptional regulator  26.27 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 191 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  22.35 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 255 aa  58.5  0.00000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1279  regulatory protein, TetR  39.24 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.211303  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 191 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
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NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 217 aa  56.6  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010524  Lcho_2120  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 234 aa  57  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.249669 
 
 
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NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  24.27 
 
 		 224 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
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NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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