129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_3313 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_3313  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  378  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.212765  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3108  TetR family transcriptional regulator  98.38 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3354  TetR family transcriptional regulator  98.38 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3326  transcriptional regulator, TetR family  98.38 
 
 		 185 aa  371  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3324  transcriptional regulator, TetR family  97.3 
 
 		 185 aa  368  1e-101  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3094  TetR family transcriptional regulator  97.3 
 
 		 185 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.432559  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 192 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 191 aa  69.3  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1776  transcriptional regulator, TetR family  21.2 
 
 		 218 aa  52.8  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0293549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  24.06 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  24.06 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 222 aa  51.6  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 194 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  38.46 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4223  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4626  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4592  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4607  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0628  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 212 aa  48.1  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.447139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 209 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 211 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  24.09 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 205 aa  47.8  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 210 aa  47.8  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4382  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4721  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.767339  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4577  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2516  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  26.87 
 
 		 197 aa  45.8  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 219 aa  45.8  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 335 aa  46.2  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 225 aa  45.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 212 aa  45.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 261 aa  45.4  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 223 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 212 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 211 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3794  putative TetR family transcriptional regulator  23.43 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 		 256 aa  44.7  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 255 aa  43.9  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  22.03 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  22.11 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1353  regulatory protein TetR  21.8 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.273808  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5643  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240264  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  25.93 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3254  putative transcriptional regulator  21.05 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.902087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.93 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.93 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.93 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.93 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  25.93 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0526  regulatory protein TetR  22.81 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  22.07 
 
 		 194 aa  42.4  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1382  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0242  regulatory protein, TetR  18.48 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3496  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 220 aa  42.7  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.942341  normal  0.33628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 212 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 195 aa  42.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  25.17 
 
 		 207 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 202 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>