More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0052 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 188 aa  376  1e-103  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  45.91 
 
 		 178 aa  126  1.0000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37450  transcriptional regulator  48.41 
 
 		 177 aa  110  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0726232  normal  0.587989 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 180 aa  104  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  38.99 
 
 		 179 aa  100  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 190 aa  90.9  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 186 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 208 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 178 aa  71.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 178 aa  67.8  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 415 aa  64.3  0.0000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 177 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 184 aa  61.6  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  29.21 
 
 		 190 aa  59.3  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  32.88 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 172 aa  57.4  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  36.79 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  31.4 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 237 aa  53.9  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  27.59 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  41.98 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  30 
 
 		 242 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  25.4 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2115  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00202765  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 214 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 231 aa  51.6  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 241 aa  51.2  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 211 aa  51.2  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 212 aa  51.2  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7862  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 240 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0504045  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1158  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.91676  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 193 aa  49.7  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 243 aa  50.4  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  35 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1739  tetracycline transcriptional regulator YcdC domain-containing protein  37.33 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2058  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00904468  normal  0.0313266 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1074  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.739181  hitchhiker  0.00943768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2179  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>