More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2157 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 187 aa  365  1e-100  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
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NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  46.33 
 
 		 177 aa  143  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 181 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  42.39 
 
 		 187 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  43.02 
 
 		 186 aa  127  8.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 177 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
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NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  39.04 
 
 		 191 aa  108  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 428 aa  95.1  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 415 aa  94.7  7e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  27.74 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 186 aa  75.1  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  36 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 178 aa  74.3  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 183 aa  71.6  0.000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
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NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 172 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 178 aa  68.6  0.00000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 205 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 189 aa  67.4  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  54.1 
 
 		 190 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 179 aa  63.5  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 187 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
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NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
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NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 357 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
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NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 185 aa  57.8  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
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NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 236 aa  57  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
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NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  24.54 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
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NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  26.62 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  33.33 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 184 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 187 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 197 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 193 aa  52.4  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 227 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 191 aa  52.4  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 183 aa  52.4  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 197 aa  52  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 227 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 219 aa  52  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 268 aa  52  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 188 aa  51.2  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 217 aa  50.4  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 298 aa  50.8  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 187 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  23.13 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 201 aa  50.4  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 244 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0424  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.652822  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0587  TetR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1941  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.842083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5390  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 189 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 185 aa  50.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 181 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 212 aa  49.7  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
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NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
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NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
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NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 205 aa  49.3  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2710  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.466457  normal  0.498996 
 
 
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NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
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NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 218 aa  49.3  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
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NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 189 aa  48.9  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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