More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4342 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  100 
 
 		 186 aa  358  2e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  99.46 
 
 		 186 aa  357  7e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  86.49 
 
 		 186 aa  312  1.9999999999999998e-84  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  53.04 
 
 		 187 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 183 aa  91.3  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  37.09 
 
 		 428 aa  65.5  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  35.95 
 
 		 415 aa  65.1  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  51.61 
 
 		 175 aa  60.5  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  33.71 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 168 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  56.36 
 
 		 180 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  48.57 
 
 		 178 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 183 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1464  TetR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.856721  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3018  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  29.6 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 237 aa  54.3  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 192 aa  54.3  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 188 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 179 aa  53.9  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  47.69 
 
 		 181 aa  53.9  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 183 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 189 aa  52.4  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 298 aa  52.8  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  29.23 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  33.63 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.82 
 
 		 182 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  50 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 190 aa  51.2  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 183 aa  51.2  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4037  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.580741 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5065  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174952  normal  0.51505 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2408  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  42.67 
 
 		 204 aa  50.4  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3664  regulatory protein, TetR  31.91 
 
 		 182 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65900  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0425501  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.29 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4162  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 167 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5351  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 195 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0124857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  40.35 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 193 aa  48.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 225 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 233 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>