More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0994 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0994  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
184 aa  361  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.885114  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  62.84 
 
 
195 aa  191  4e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 
179 aa  147  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36720  transcriptional regulator  40.8 
 
 
179 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.72942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0756  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 
206 aa  108  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0490671  hitchhiker  0.00390743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2859  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 
186 aa  107  8.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.111234  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  55 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36230  transcriptional regulator, tetR family  34.01 
 
 
187 aa  58.9  0.00000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.552235  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
241 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 
193 aa  53.9  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 
216 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0536  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 
204 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.613933  normal  0.25181 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  30.25 
 
 
226 aa  53.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  33.78 
 
 
192 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3665  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 
228 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 
223 aa  53.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1590  transcriptional regulator, TetR family  56 
 
 
231 aa  53.1  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 
226 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 
207 aa  52.8  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
243 aa  52.8  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
332 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3471  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3759  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.341264  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1558  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 
204 aa  52  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.231141  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  33.02 
 
 
222 aa  52  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2679  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 
204 aa  52  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
202 aa  52  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0140  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 
176 aa  51.2  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 
203 aa  50.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
187 aa  50.4  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5861  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
197 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.356858 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1837  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 
202 aa  50.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28300  transcriptional regulator  34.31 
 
 
280 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
209 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3300  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
204 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.161696 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 
238 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
195 aa  49.7  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
183 aa  49.7  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1872  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
204 aa  49.7  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.598992  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 
190 aa  50.1  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  43.75 
 
 
210 aa  49.7  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1392  transcriptional regulator, TetR family  47.73 
 
 
205 aa  50.1  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3772  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.392718  normal  0.705056 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  40.82 
 
 
186 aa  50.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  23.84 
 
 
196 aa  50.1  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
203 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  36.05 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  45.71 
 
 
212 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 
222 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 
186 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  39.53 
 
 
222 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  26.71 
 
 
219 aa  49.3  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  41.38 
 
 
260 aa  49.3  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
215 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1976  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 
181 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.87 
 
 
217 aa  48.9  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
231 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
221 aa  48.9  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2355  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
201 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 
227 aa  48.5  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 
207 aa  48.5  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  41.67 
 
 
222 aa  48.1  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  41.67 
 
 
221 aa  48.5  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  32.5 
 
 
346 aa  48.5  0.00006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 
291 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 
193 aa  48.1  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2192  regulatory protein, TetR  32.18 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0820152  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
204 aa  48.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  40 
 
 
197 aa  48.1  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
207 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 
186 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  41.67 
 
 
198 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  44.23 
 
 
187 aa  47.8  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 
222 aa  47.8  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 
255 aa  47.8  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 
198 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 
191 aa  47.8  0.00009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1780  transcriptional regulator, TetR family  39.73 
 
 
200 aa  47.8  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
208 aa  47.8  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
208 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 
201 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 
201 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
197 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  34.45 
 
 
223 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
189 aa  47  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
225 aa  47.4  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 
201 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4153  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 
234 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
190 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>