More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5162 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  58.03 
 
 		 209 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 183 aa  68.9  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  34.75 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 172 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  30.68 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  33.58 
 
 		 186 aa  59.3  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  33.58 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  45.07 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  29.55 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 178 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  48.15 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  32.23 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 187 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  47.54 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 189 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 168 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 178 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 187 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  39.39 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 188 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  31.78 
 
 		 298 aa  49.3  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 168 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 179 aa  48.9  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 187 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 186 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 227 aa  48.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 198 aa  48.1  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 285 aa  48.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  38.33 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0740  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.156291  normal  0.856133 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0746  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  27.74 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0760  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.650224  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  41.38 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 245 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 200 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 244 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 214 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  38.24 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.76 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1023  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 269 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.048156  normal  0.0140553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 195 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 87 aa  46.2  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 226 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 209 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 219 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>