134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2389 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  61.5 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 193 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 428 aa  63.9  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  33.64 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  29.76 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  24.42 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 179 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 183 aa  52  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 235 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 415 aa  51.6  0.000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 178 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  24.72 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  38.46 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 182 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 178 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 187 aa  48.1  0.00008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  25.98 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  33.87 
 
 		 212 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 186 aa  46.6  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 204 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 187 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 177 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 181 aa  45.1  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1116  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 184 aa  45.1  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31090  transcriptional regulator, tetR family  40.82 
 
 		 177 aa  45.1  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.565118  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 188 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 192 aa  44.7  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 195 aa  43.9  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.21 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 293 aa  44.3  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 200 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 236 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 188 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 168 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  28.09 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 304 aa  43.9  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 175 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 187 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>