More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3293 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  100 
 
 		 208 aa  414  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  47.22 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  44.68 
 
 		 213 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 198 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  46.39 
 
 		 205 aa  125  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  47.34 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 208 aa  119  3e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  51.88 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 204 aa  116  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  47.98 
 
 		 227 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  47.55 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 201 aa  111  9e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 224 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 209 aa  105  3e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  43.71 
 
 		 207 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  41.04 
 
 		 196 aa  101  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 230 aa  98.6  6e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  42.48 
 
 		 167 aa  97.1  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  37.2 
 
 		 183 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  39.88 
 
 		 195 aa  89.4  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 192 aa  77  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  49.32 
 
 		 186 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  44.74 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 197 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40.66 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  47.69 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  48.53 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 299 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1515  regulatory protein, TetR  40.22 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  59.52 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  49.32 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  50.88 
 
 		 223 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 227 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  39.29 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2832  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 194 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5419  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 257 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3008  putative transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 173 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 266 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  32.76 
 
 		 185 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 213 aa  48.9  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  39.74 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 		 196 aa  48.9  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 185 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0250  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.804071  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 192 aa  48.5  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0767  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  48.5  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.504408  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>