More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4309 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  81.34 
 
 		 208 aa  269  2e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  62.98 
 
 		 204 aa  229  3e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  70.19 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  70.19 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  70.19 
 
 		 200 aa  222  3e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  47.34 
 
 		 200 aa  153  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  48.09 
 
 		 208 aa  145  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  40.64 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 205 aa  122  4e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  42.7 
 
 		 201 aa  122  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  46.56 
 
 		 198 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  47.34 
 
 		 208 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  47.93 
 
 		 216 aa  111  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  47.89 
 
 		 188 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 183 aa  105  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  41.71 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  44.81 
 
 		 224 aa  98.2  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  43.37 
 
 		 207 aa  95.9  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  38.01 
 
 		 167 aa  91.3  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  41.84 
 
 		 195 aa  82  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 		 192 aa  78.2  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  42.95 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  45.98 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  45.97 
 
 		 224 aa  65.1  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  58.62 
 
 		 228 aa  62.4  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  35.54 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 193 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  52.31 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2574  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 204 aa  53.1  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 268 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  51.67 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4250  transcriptional regulator, TetR family  38.54 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  67.39 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  60.98 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1362  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  45.83 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2204  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.546979  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  41.67 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  39.37 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4147  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 234 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0435  TetR family transcriptional regulator  51.72 
 
 		 184 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  51.79 
 
 		 223 aa  49.3  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 191 aa  48.9  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 266 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 179 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  34.43 
 
 		 185 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2069  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.327504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  37.97 
 
 		 258 aa  48.5  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0500  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  49.23 
 
 		 193 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 183 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 196 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 207 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 230 aa  47  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  35.85 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>