More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5465 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 195 aa  377  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  56.08 
 
 		 188 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  44.25 
 
 		 213 aa  133  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  47.31 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  48.19 
 
 		 167 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 220 aa  114  8.999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  45.5 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  39.88 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  37.43 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  47.65 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 183 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 230 aa  96.7  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 204 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 186 aa  85.1  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  46.11 
 
 		 192 aa  84.7  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  42.51 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 216 aa  83.6  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 198 aa  76.6  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  53.52 
 
 		 208 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  40.36 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 209 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  38.67 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  27.49 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 188 aa  61.6  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  55.17 
 
 		 216 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  52.63 
 
 		 179 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  56.14 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 205 aa  57  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  40.7 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 174 aa  55.8  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  50.82 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4457  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.108103 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 245 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  56.6 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  41.67 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3964  regulatory protein, TetR  38.14 
 
 		 174 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  48.44 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  47.5 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1959  transcriptional regulator, TetR family  52.54 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0909176  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  44.83 
 
 		 223 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 263 aa  52  0.000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 299 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 202 aa  51.2  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  38.05 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  51.06 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.33 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  44.12 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0137  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  32.53 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1060  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1788  transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4743  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.832036  normal  0.727268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8507  putative transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3284  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.961661 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0512  TetR family transcriptional regulator  31.95 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2192  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 225 aa  48.9  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 199 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>