More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1652 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  69.88 
 
 		 183 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  52.86 
 
 		 188 aa  128  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 230 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  41.88 
 
 		 167 aa  111  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 201 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  41.04 
 
 		 208 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  43.85 
 
 		 205 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  50.35 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  38.04 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  51.57 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  41.48 
 
 		 224 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 216 aa  87.8  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  47.71 
 
 		 208 aa  87.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  46.91 
 
 		 224 aa  85.9  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  42.26 
 
 		 204 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  37.97 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  47.01 
 
 		 208 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 200 aa  67.8  0.00000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 195 aa  65.1  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  40.2 
 
 		 176 aa  60.8  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  44.78 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 207 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 205 aa  54.7  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  36.3 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  53.33 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  46.97 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4823  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5801  regulatory protein TetR  49.25 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.813515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1459  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.540117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 216 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 197 aa  51.6  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 245 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 228 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5421  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 182 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.211014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  54.72 
 
 		 195 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5119  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.891225  normal  0.419875 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 223 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  23.37 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 216 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27620  transcriptional regulator  50.82 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.475426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4516  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125793  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 248 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 188 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  39.33 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 189 aa  49.3  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 227 aa  49.3  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  26.17 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 238 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5172  transcriptional regulator, TetR family  57.69 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 192 aa  48.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>