More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7116 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 183 aa  357  4e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1652  transcriptional regulator, TetR family  71.19 
 
 		 196 aa  221  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.289952  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2504  putative transcriptional regulator, TetR family  52.94 
 
 		 188 aa  132  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5356  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 230 aa  114  5e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4774  transcriptional regulator, TetR family  46.82 
 
 		 220 aa  109  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0197844  hitchhiker  0.000543093 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4287  transcriptional regulator, TetR family  45.26 
 
 		 205 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20280  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 213 aa  108  5e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3293  regulatory protein TetR  40 
 
 		 208 aa  104  8e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.147599  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1442  transcriptional regulator, TetR family  39.86 
 
 		 167 aa  103  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13072  TetR family transcriptional regulator  42.08 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.483288 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1571  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 227 aa  97.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.538568  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34410  transcriptional regulator  34.62 
 
 		 200 aa  94.7  6e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.38267  normal  0.633613 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1216  transcriptional regulator, TetR family  41.95 
 
 		 224 aa  92.8  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.187428 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 224 aa  92  4e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4018  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 216 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2038  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.473719 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2973  transcriptional regulator, TetR family  40.49 
 
 		 198 aa  87.8  7e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5465  putative transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 195 aa  87  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0907428 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4309  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 209 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1813  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1860  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.237436 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1794  TetR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 200 aa  81.6  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0486458  normal  0.960554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3360  regulatory protein, TetR  45.26 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.683642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3019  transcriptional regulator, TetR family  41.61 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.190372  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3680  TetR family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0721  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 192 aa  70.9  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 176 aa  68.9  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0528  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 192 aa  67.8  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0143  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 266 aa  67.8  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.170765  normal  0.0134311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4837  transcriptional regulator, TetR family  37.64 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000934905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  52.24 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  43.1 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2165  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.289199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  58.49 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2757  transcriptional regulator, TetR family  54.72 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.331612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  45.24 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2615  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  54.39 
 
 		 173 aa  58.2  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7965  transcriptional regulator, TetR family  47.76 
 
 		 192 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  41.58 
 
 		 213 aa  57.8  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3691  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.811225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0257  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0767  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0401  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0464223  normal  0.180866 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2539  TetR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.480569  hitchhiker  0.0000324052 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0570  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1139  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.564798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1543  TetR family transcriptional regulator  45.68 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.470889 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5863  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.602897  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  37.5 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2714  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 183 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000526113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  34.58 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2209  putative transcriptional regulator, TetR family  50.82 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.594451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0946  TetR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 223 aa  55.1  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.123031  normal  0.934208 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  43.04 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 232 aa  54.3  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 189 aa  54.3  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6198  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.533125  normal  0.545762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 216 aa  53.9  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 190 aa  53.9  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2786  regulatory protein TetR  40.79 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5689  transcriptional regulator, TetR family  40.24 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.784661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4255  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 223 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.228182 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  33.01 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 259 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  40.4 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>