More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4044 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3517  transcriptional regulator protein  29.44 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.873146  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00902  transcription regulator protein  29.73 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.806346  normal  0.603909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 236 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 220 aa  72.4  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2329  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 221 aa  72.4  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0106  transcriptional regulator  28.65 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8304  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.505381  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 205 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00486  transcriptional regulator, TetR family protein  33.83 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3994  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3129  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 218 aa  68.6  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  35.11 
 
 		 219 aa  68.6  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5823  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3915  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 215 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6188  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.301672  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6667  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.33995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  29.47 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6592  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.186395 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4190  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.378174  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1231  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 289 aa  67.8  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00074883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18820  transcriptional regulator  34.59 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.348199  normal  0.343375 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3451  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.6413 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4150  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3644  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.106311  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 220 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7734  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 214 aa  67.4  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1885  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.393011  normal  0.0927704 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.922562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 220 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1609  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8267  putative transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 209 aa  65.9  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.124724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  25.25 
 
 		 217 aa  65.1  0.0000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2285  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 233 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.522027  normal  0.380806 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1142  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.282615  normal  0.594609 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0706  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 209 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1461  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3682  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 540 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0191871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 224 aa  63.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5419  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.752491  normal  0.799332 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2650  TetR family transcriptional regulator  34.01 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0440  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2701  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3443  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.61751 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6562  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.67895  normal  0.0476005 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4417  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 206 aa  62  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2416  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.363583 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 216 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 238 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5077  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  29.2 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06672  hypothetical protein  32.46 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1312  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.278349  normal  0.387509 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1544  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1222  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  50.85 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_4478  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
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NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
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NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_2507  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.881075  normal  0.842438 
 
 
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NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_0542  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.669667 
 
 
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NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
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NC_007493  RSP_6137  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.150449  n/a   
 
 
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NC_007964  Nham_0716  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281964  n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  24.2 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  29.3 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
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