110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31090 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_31090  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 177 aa  343  1e-93  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.565118  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 187 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  34.27 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 188 aa  64.7  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 186 aa  60.5  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  33.33 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  29.5 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 227 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 227 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 184 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  55.56 
 
 		 172 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 177 aa  51.6  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 186 aa  50.8  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 181 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 178 aa  48.9  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 183 aa  47.8  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 186 aa  47.8  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 208 aa  47  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  58.82 
 
 		 181 aa  47  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 175 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  41.86 
 
 		 209 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3695  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 218 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.551475  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 202 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  42.62 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 185 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  55.1 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 202 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 187 aa  45.1  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 203 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  29.12 
 
 		 212 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 226 aa  44.7  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 193 aa  45.1  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 204 aa  45.1  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 178 aa  44.7  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 204 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  34.06 
 
 		 179 aa  44.3  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 203 aa  44.3  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 244 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  48.65 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3739  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  30.13 
 
 		 186 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3812  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.246252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 188 aa  43.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 428 aa  43.5  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 179 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  41.27 
 
 		 216 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 196 aa  42.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 183 aa  42.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 180 aa  42.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 234 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  59.38 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  39.22 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4204  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 213 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 212 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 200 aa  42  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 200 aa  42  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 200 aa  41.6  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2447  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 208 aa  42  0.005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 209 aa  42  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 230 aa  42  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6123  transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 232 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.417481  normal  0.0113351 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 183 aa  41.6  0.006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3724  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.29601  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 200 aa  41.6  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 189 aa  41.6  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 228 aa  41.6  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>