More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2152 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 185 aa  370  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  53.98 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 182 aa  164  5e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  51.12 
 
 		 212 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 190 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 186 aa  118  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 184 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  32.75 
 
 		 187 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 187 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  52.54 
 
 		 183 aa  68.6  0.00000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 172 aa  65.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 183 aa  66.2  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 181 aa  65.1  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 179 aa  63.2  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 199 aa  62.4  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 201 aa  62  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  37.76 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  30.58 
 
 		 177 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 187 aa  57.8  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 180 aa  57.8  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 415 aa  56.6  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  40.91 
 
 		 179 aa  54.3  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 189 aa  53.1  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  26.74 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 228 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  48.15 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4859  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 186 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.205859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19140  hypothetical protein  43.08 
 
 		 188 aa  52  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0125477  normal  0.347466 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 192 aa  51.6  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2659  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 418 aa  51.6  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  53.19 
 
 		 196 aa  51.6  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 216 aa  51.2  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3172  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.547125 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1186  HTH-type transcriptional regulator RutR  30 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1231  HTH-type transcriptional regulator RutR  30 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.696174  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1081  HTH-type transcriptional regulator RutR  30 
 
 		 212 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31090  transcriptional regulator, tetR family  29.82 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.565118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 188 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1216  HTH-type transcriptional regulator RutR  29.09 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.591915 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1824  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87921  normal  0.175095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  39.33 
 
 		 220 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2840  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.503286 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1365  transcriptional regulator  32.58 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.575727 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1196  HTH-type transcriptional regulator RutR  30.59 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1198  transcriptional regulator BetI  23.81 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000245724 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>