More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6105 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  98.01 
 
 		 236 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  88.24 
 
 		 227 aa  327  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  87.7 
 
 		 191 aa  325  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  88.11 
 
 		 227 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  91.62 
 
 		 244 aa  320  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  84.44 
 
 		 185 aa  275  4e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 199 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 187 aa  98.2  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 187 aa  95.5  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 178 aa  88.6  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 192 aa  88.2  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 187 aa  87.8  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 208 aa  86.7  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 		 188 aa  86.3  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 186 aa  85.9  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 178 aa  85.5  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  32.63 
 
 		 187 aa  85.1  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 168 aa  84  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 357 aa  79  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  35.4 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 183 aa  73.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
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NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  35.68 
 
 		 187 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 175 aa  72.4  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 179 aa  72  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  47.3 
 
 		 141 aa  68.2  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  28.07 
 
 		 185 aa  62  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 178 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
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NC_011988  Avi_5677  regulatory protein  45.33 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.106455  n/a   
 
 
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NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
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NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  31.89 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
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NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  36.7 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  43.08 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  50.98 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  50.98 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 172 aa  54.3  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 261 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 235 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  35.29 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2530  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.704068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 184 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  38.33 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2639  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2000  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2657  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2610  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341012  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.78 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5941  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 213 aa  52.8  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  36.54 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 231 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 210 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 181 aa  51.6  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
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NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 225 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
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NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
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NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 238 aa  51.6  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
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NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
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