More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_1329 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 205 aa  419  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  41.29 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 212 aa  82.4  0.000000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  28.86 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 202 aa  66.2  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0020  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.390674  normal  0.0209926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1039  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68157  normal  0.029552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  27.14 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  25.65 
 
 		 220 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.68 
 
 		 198 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 196 aa  58.9  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  24.12 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1790  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.508898 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1777  regulatory protein TetR  29.63 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.731609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 214 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  28.4 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  22.05 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 179 aa  56.6  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0778  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4249  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.399807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0124  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 298 aa  55.5  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1734  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.390922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4138  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.122439  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  21.74 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  27 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 219 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  26.01 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 223 aa  54.3  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1903  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0461172  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  40.74 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  24.14 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02185  transcriptional regulator  22.22 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.69519  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 186 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3845  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 242 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.39 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 193 aa  52  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6780  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.188016 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  36.59 
 
 		 234 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  21.11 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4533  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0169871 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>