More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0275 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  391  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  91.71 
 
 		 209 aa  355  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  91.19 
 
 		 209 aa  351  4e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  88.02 
 
 		 209 aa  348  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 209 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  87.5 
 
 		 209 aa  316  1e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  86.46 
 
 		 193 aa  312  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  92.19 
 
 		 209 aa  304  6e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  49.46 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 193 aa  94  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  34.3 
 
 		 193 aa  89.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 189 aa  84.7  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 192 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 191 aa  79.3  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 194 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 192 aa  76.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 194 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 194 aa  74.7  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 		 192 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  29.57 
 
 		 189 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  31.58 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  35.8 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  28.35 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  29.65 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  25.56 
 
 		 191 aa  66.6  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  34.13 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 214 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1329  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.851315 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 199 aa  62  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  30.7 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  26.44 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 176 aa  59.3  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1674  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  27.57 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  23.63 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 310 aa  58.2  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 197 aa  57.8  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 206 aa  57  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  33.59 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6222  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.366462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 191 aa  56.2  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0482  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2564  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 311 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1763  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139552  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1872  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0047199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>