165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0798 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 194 aa  382  1e-105  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  44.07 
 
 		 195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  43.62 
 
 		 193 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  41.92 
 
 		 196 aa  129  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  39.57 
 
 		 194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  41.44 
 
 		 200 aa  122  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  42.16 
 
 		 191 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 194 aa  115  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 194 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  115  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  42.46 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 194 aa  108  5e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 199 aa  105  3e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 203 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 175 aa  80.5  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  31.11 
 
 		 189 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 205 aa  78.6  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 186 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  31.32 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 209 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 193 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3237  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0582489  normal  0.651915 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5860  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 191 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 212 aa  63.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 193 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  29.07 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 209 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  27.57 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5685  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  30.99 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5306  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5395  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.488916  normal  0.171159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.02 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  22.29 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 190 aa  52  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1060  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0130577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  19.87 
 
 		 208 aa  50.4  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3295  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.457543 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0913  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 186 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.457382 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 194 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 188 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 207 aa  48.5  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  26.67 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  21.54 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7842  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.341573  normal  0.515425 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  23.44 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 237 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 240 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2260  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 201 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0104994  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  30.06 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  21.18 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 229 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  24.41 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2134  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 186 aa  45.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  45.4  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 196 aa  45.1  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5205  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.278778  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3052  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 183 aa  44.7  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.186092 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 188 aa  44.7  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2179  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.277045 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  20.47 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 203 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>