109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0216 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 175 aa  351  4e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  99.03 
 
 		 205 aa  207  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10198  transcriptional regulator  44.34 
 
 		 194 aa  100  7e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3287  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.482502 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3009  TetR family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 199 aa  88.2  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101347  normal  0.721246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2720  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 194 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.532546  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2764  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 194 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2750  TetR family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 194 aa  85.1  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.209675  normal  0.0475693 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0275  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 193 aa  84  9e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.280469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6178  transcriptional regulator, TetR family  42.2 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2958  transcriptional regulator, TetR family  42.71 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0440878  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5683  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 189 aa  80.9  0.000000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 194 aa  80.1  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0726  regulatory protein TetR  38.38 
 
 		 200 aa  79.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01911  putative transcription regulator protein  37.37 
 
 		 191 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0303213 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  37.38 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5016  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 191 aa  76.3  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000793722  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0685  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 192 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0111634 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3452  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0294937  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4482  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14402  normal  0.0182705 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2194  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.285199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7118  putative transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0105564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0735  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.177644  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06210  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0238159 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9229  transcriptional regulator TetR family  33.33 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.21864  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4133  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4649  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.490512  normal  0.521268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0581  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5526  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5890  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.223104  normal  0.394498 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6399  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.147882 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 192 aa  51.2  0.000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2843  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 209 aa  51.2  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  30 
 
 		 204 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0274  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 193 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3185  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 192 aa  48.9  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 252 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2269  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 197 aa  48.1  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4057  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3880  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 217 aa  47  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.133053 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2732  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 200 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 251 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 201 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 210 aa  45.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  45.4  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 215 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 194 aa  45.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 200 aa  45.1  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 194 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1963  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 190 aa  44.3  0.0009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.264679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 201 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0973  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.269206  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  40.38 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 197 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1740  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.976934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 211 aa  43.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 206 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 183 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 332 aa  42.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2164  regulatory protein, TetR  32.2 
 
 		 209 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 224 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 268 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 181 aa  42.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 224 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5671  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 221 aa  42  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 188 aa  42  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 209 aa  42  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 188 aa  42  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 233 aa  42  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  24.75 
 
 		 194 aa  41.6  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 206 aa  41.6  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 209 aa  41.6  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 186 aa  41.6  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 222 aa  41.6  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 212 aa  41.2  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 172 aa  41.6  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  41.2  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 226 aa  41.2  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 213 aa  41.2  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>