154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3709 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  388  1e-107  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  68.02 
 
 		 197 aa  254  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  67.22 
 
 		 187 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  65.03 
 
 		 190 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  60.22 
 
 		 186 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0730  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000193069  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  29.27 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  36.49 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  27.71 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  28.05 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 205 aa  48.5  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  30.56 
 
 		 198 aa  48.1  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  55 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.48 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 221 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0216  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0206  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.611612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.12 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  23.47 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 194 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3670  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 197 aa  45.1  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.411004  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 202 aa  45.1  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 191 aa  44.7  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 221 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 221 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  31.48 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 286 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  35.29 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 213 aa  44.3  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 191 aa  44.7  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 215 aa  44.3  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.78 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.78 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  43.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  43.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.78 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 207 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.78 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.78 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 259 aa  43.5  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 257 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4220  TetR family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.267151 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 242 aa  43.1  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 231 aa  43.1  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 204 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  33.87 
 
 		 224 aa  43.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 215 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>