79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0730 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0730  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  400  1e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000193069  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  52.36 
 
 		 196 aa  192  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 197 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 187 aa  61.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  31.19 
 
 		 190 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  22.16 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 196 aa  48.1  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.37 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 223 aa  47.8  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  22.86 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  24.84 
 
 		 193 aa  46.2  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1692  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  20 
 
 		 193 aa  45.4  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  19.32 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  29.51 
 
 		 214 aa  45.1  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  20.1 
 
 		 209 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  19.19 
 
 		 251 aa  44.3  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4031  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 221 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  22.94 
 
 		 335 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 242 aa  44.3  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  23.68 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  27.78 
 
 		 220 aa  43.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0969  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.19098 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  22.13 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4009  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  18.52 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  19.9 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 220 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  24.77 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  22.31 
 
 		 236 aa  42.4  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  20.21 
 
 		 190 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 223 aa  42.7  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 219 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  24.07 
 
 		 240 aa  42.4  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 238 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  24.77 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3140  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  17.28 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 215 aa  42  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0077  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 183 aa  42  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.234691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  22.31 
 
 		 219 aa  42  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  31.25 
 
 		 194 aa  42  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 222 aa  42  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 221 aa  41.6  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 227 aa  41.6  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 222 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  23.15 
 
 		 208 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  21.26 
 
 		 190 aa  41.2  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 		 192 aa  41.2  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 200 aa  41.2  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 198 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 198 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 179 aa  41.2  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2364  TetR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 210 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 221 aa  41.2  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>