86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_0562 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  68.02 
 
 		 200 aa  254  6e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  67.98 
 
 		 190 aa  226  1e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  60.67 
 
 		 187 aa  215  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  59.55 
 
 		 186 aa  214  5e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0730  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000193069  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  24.08 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  24.08 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  55 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  32.73 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0501  nucleoid occlusion protein  21.43 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.957497  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  45.65 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 200 aa  45.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 212 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 236 aa  43.9  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 202 aa  44.3  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  29.31 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4072  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.404237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  39.13 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 286 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 242 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  22.83 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 194 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 218 aa  42.7  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  20.44 
 
 		 196 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 189 aa  42.7  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 196 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 194 aa  42.4  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  23.71 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  25.49 
 
 		 228 aa  42.4  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  20.59 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 204 aa  42  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 215 aa  42  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  27.05 
 
 		 208 aa  42  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 194 aa  41.6  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 188 aa  41.6  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 216 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  24.68 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1835  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 206 aa  41.2  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.214675  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 216 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2750  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 205 aa  41.2  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.172363  normal  0.153941 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 216 aa  41.2  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 185 aa  41.2  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 215 aa  41.2  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5750  transcriptional regulator, TetR family  18.69 
 
 		 193 aa  41.2  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0412881  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>