141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_4190 on replicon NC_013518
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  365  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  67.98 
 
 		 197 aa  241  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  66.29 
 
 		 187 aa  236  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3709  transcriptional regulator, TetR family  65.03 
 
 		 200 aa  229  2e-59  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0327  transcriptional regulator, TetR family  55.62 
 
 		 186 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3413  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000152623  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0730  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000193069  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  27.47 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 242 aa  50.1  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  48.9  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  48.9  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 218 aa  48.1  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  23.6 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 215 aa  47  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 213 aa  47.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 223 aa  47.4  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 227 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  44.19 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  23.28 
 
 		 234 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 239 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 		 236 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2309  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.160392  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  46.51 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23280  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  31.03 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 221 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 215 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5186  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 185 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225373  normal  0.188797 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  27.59 
 
 		 217 aa  45.1  0.0006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 238 aa  45.1  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 241 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 252 aa  44.7  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 241 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 252 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 252 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 244 aa  44.7  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 252 aa  44.7  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 251 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.0009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3666  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  44.7  0.0009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 251 aa  44.7  0.0009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 194 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 253 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3253  transcriptional regulator  38 
 
 		 194 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0516477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  20.53 
 
 		 243 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  31.48 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1007  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 194 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.587433  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 242 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  36.73 
 
 		 199 aa  43.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0322  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 223 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.541277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  29.31 
 
 		 217 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>