More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0219 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0219  regulatory protein, TetR  100 
 
 		 211 aa  413  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 208 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0220  regulatory protein, TetR  41.84 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9073  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 263 aa  58.5  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1537  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  27.23 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 335 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2692  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2510  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 291 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1598  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 239 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 221 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5412  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00435132  normal  0.234222 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  24.41 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  19.74 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2081  transcriptional regulator, TetR family  31.09 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.586313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1426  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 260 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 185 aa  52.4  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 215 aa  52  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 211 aa  51.6  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 199 aa  51.6  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.5 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.78 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  36.51 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0332  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 227 aa  50.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 332 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 213 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  31.82 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6653  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.713495  normal  0.0271875 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 202 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1598  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.535122  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6233  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.275362  normal  0.0744328 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  38.78 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4635  regulatory protein, TetR  38.98 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.78 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.78 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.78 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  33.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 198 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.78 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  33.33 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.78 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>