294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0472 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  100 
 
 		 213 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  94.84 
 
 		 213 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  94.84 
 
 		 213 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  89.2 
 
 		 213 aa  388  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  88.73 
 
 		 212 aa  386  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  80.61 
 
 		 199 aa  326  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  79.59 
 
 		 199 aa  324  7e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  80.1 
 
 		 201 aa  323  1e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  78.06 
 
 		 199 aa  315  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 199 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 199 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  77.55 
 
 		 199 aa  313  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  77.04 
 
 		 199 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  77.04 
 
 		 199 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  77.04 
 
 		 199 aa  309  2e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  76.02 
 
 		 199 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 233 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  59.07 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  58.71 
 
 		 219 aa  232  3e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  57.21 
 
 		 226 aa  231  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  55.61 
 
 		 269 aa  231  9e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 342 aa  229  3e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  55.67 
 
 		 221 aa  226  2e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  55.67 
 
 		 221 aa  224  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  55.15 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  52.68 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  49.49 
 
 		 200 aa  192  4e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  51.28 
 
 		 200 aa  187  7e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 198 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  45.2 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  45.2 
 
 		 198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  46.02 
 
 		 221 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  39.38 
 
 		 202 aa  127  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 193 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  40.37 
 
 		 218 aa  111  9e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  37.95 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 207 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 197 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  33.14 
 
 		 198 aa  89.4  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  47.73 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 202 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  35.83 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2793  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 214 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1186  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 206 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3182  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3326  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3183  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1144  TetR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00178929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  22.75 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4260  putative transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.370014  normal  0.537998 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0900  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308807  normal  0.448888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  26.4 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1495  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 204 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000123966  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1087  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  51.6  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00014413  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 252 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  28.32 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  21.95 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  25.54 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2547  TetR family transcriptional regulator  19.79 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.28213  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 197 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  27.47 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 223 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4700  transcriptional regulator, TetR family  27.38 
 
 		 224 aa  48.9  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0565878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 190 aa  48.9  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  31.93 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5881  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752924 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>