212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6800 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  408  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  40.89 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  46.19 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 198 aa  128  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  45.34 
 
 		 198 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  45.34 
 
 		 198 aa  121  9e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 201 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 219 aa  118  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  38.71 
 
 		 226 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 196 aa  112  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  38.01 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 342 aa  112  5e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  41.14 
 
 		 193 aa  111  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 221 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 247 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  38.41 
 
 		 202 aa  108  7.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 202 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 269 aa  104  8e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  37.89 
 
 		 233 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  39.51 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 202 aa  102  6e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 201 aa  101  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  43.24 
 
 		 195 aa  98.2  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  39.52 
 
 		 197 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  36.75 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 199 aa  95.5  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 201 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 199 aa  94  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 199 aa  94  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 213 aa  92  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 200 aa  86.3  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 196 aa  85.5  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  39.15 
 
 		 207 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  32.03 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 213 aa  67.4  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  43.33 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  25.54 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.37 
 
 		 199 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 202 aa  54.7  0.0000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  27.81 
 
 		 185 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3375  TetR family transcriptional regulator  21.91 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001160  transcriptional regulator  23.46 
 
 		 181 aa  49.7  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.48 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  20.31 
 
 		 195 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0985  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2332  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 193 aa  48.9  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.950158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 357 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  32.8 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2980  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08850  transcriptional regulator  44.23 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0839  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2801  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0796  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.091153  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  24.6 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 191 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 203 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2884  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3290  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 225 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.413178  normal  0.0802991 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>