More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0420 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0420  TetR family regulatory protein  100 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.418633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4033  TetR family transcriptional regulator  75.36 
 
 		 219 aa  315  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000937448 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3958  TetR family transcriptional regulator  69.31 
 
 		 260 aa  300  2e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3478  TetR family transcriptional regulator  65.88 
 
 		 247 aa  290  1e-77  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.346656  normal  0.546304 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0570  transcriptional regulator, TetR family  66.02 
 
 		 221 aa  286  2e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1336  TetR family transcriptional regulator  66.05 
 
 		 235 aa  285  2.9999999999999996e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.745896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0591  TetR family transcriptional regulator  64.62 
 
 		 221 aa  285  4e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1225  TetR family transcriptional regulator  64.25 
 
 		 269 aa  284  9e-76  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  67.5 
 
 		 233 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4090  TetR family transcriptional regulator  64.15 
 
 		 342 aa  277  9e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  67.72 
 
 		 236 aa  275  6e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0679  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0855  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0563  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2409  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  1e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  59.38 
 
 		 199 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  236  3e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  58.85 
 
 		 199 aa  234  8e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 199 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0384  TetR family transcriptional regulator  58.85 
 
 		 201 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.384249  normal  0.354383 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  57.21 
 
 		 213 aa  231  5e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  57.71 
 
 		 212 aa  230  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 213 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  58.76 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  58.76 
 
 		 213 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0062  transcriptional regulator, TetR family  46.63 
 
 		 200 aa  189  2e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0119  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 200 aa  188  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.207214 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 198 aa  178  5.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 198 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  46.6 
 
 		 198 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3099  TetR family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 221 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00451486  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1231  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 196 aa  149  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.811741  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 224 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2565  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.908518  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 201 aa  131  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5083  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 193 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0088  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 207 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.783228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5178  putative transcriptional regulator, TetR family  42.01 
 
 		 197 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.519918  hitchhiker  0.00157317 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0154  transcriptional regulator, TetR family  35.93 
 
 		 201 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.01505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0058  transcriptional regulator, TetR family  40.12 
 
 		 216 aa  119  4.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6800  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813677  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2858  transcriptional regulator, TetR family  39.53 
 
 		 218 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1907  putative transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 218 aa  102  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2281  hypothetical protein  32.52 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4669  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12190  hypothetical protein  48.86 
 
 		 211 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.52928e-50  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3420  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 202 aa  87.4  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000947  transcriptional regulator  30.36 
 
 		 196 aa  84.3  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06958  transcriptional regulator  29.94 
 
 		 198 aa  82  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3074  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 224 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5162  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122941 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4633  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.458937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1076  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0815  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.642279  normal  0.93191 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1649  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.279043 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  22.02 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4537  transcriptional regulator, TetR family  22.36 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.340013  normal  0.0119033 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2862  TetR family transcriptional regulator  22.09 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00162474  hitchhiker  0.00695972 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1072  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000136093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3494  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.56 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1617  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0133761 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4844  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 252 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  27.93 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0550  regulatory protein, TetR  25.19 
 
 		 199 aa  53.1  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5165  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.707616 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  23.94 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>