More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3810 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  73.06 
 
 		 193 aa  296  1e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.81 
 
 		 186 aa  109  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 189 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  34.95 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 196 aa  95.9  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 191 aa  85.9  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 252 aa  85.5  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3648  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 201 aa  78.6  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 198 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 187 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 187 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 190 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 209 aa  74.7  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  30.99 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  30.69 
 
 		 191 aa  74.7  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 185 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 200 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 191 aa  74.3  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 201 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 199 aa  72.8  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 192 aa  72.4  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 180 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 184 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 187 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
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NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 191 aa  70.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 185 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 190 aa  69.7  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 213 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 186 aa  68.6  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 182 aa  67  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 218 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 192 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4681  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.972531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  31.06 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 179 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 199 aa  64.7  0.0000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  28.04 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  28.34 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2005  transcriptional regulator, TetR family  36.28 
 
 		 193 aa  62  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.848045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 179 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
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NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  28.99 
 
 		 200 aa  61.6  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
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NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
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NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
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NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  38.96 
 
 		 212 aa  61.2  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  29.41 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_05760  Transcriptional regulatory protein, TetR family  26.45 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.466087  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 189 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
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NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
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NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
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NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
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NC_008709  Ping_3701  transcriptional regulator of TetR family protein  28.32 
 
 		 206 aa  57  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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