More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4037 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 185 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  58.89 
 
 		 186 aa  220  8e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  59.34 
 
 		 189 aa  218  5e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  58.79 
 
 		 188 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  56.59 
 
 		 189 aa  208  3e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  61.67 
 
 		 190 aa  202  3e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 196 aa  115  3e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 252 aa  115  3e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 192 aa  115  3e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0977252 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 218 aa  111  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 222 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  34.87 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 221 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4347  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 190 aa  104  8e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 196 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 211 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 191 aa  102  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 218 aa  101  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  37.16 
 
 		 195 aa  99  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 204 aa  97.4  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 180 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 203 aa  95.1  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 192 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 198 aa  94.7  7e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  32.8 
 
 		 191 aa  94.7  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 193 aa  94.7  7e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  35.52 
 
 		 206 aa  94.4  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 192 aa  94.4  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 201 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  34.76 
 
 		 199 aa  93.6  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  31.91 
 
 		 191 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  33.68 
 
 		 180 aa  92.4  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 194 aa  92.4  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 199 aa  92.8  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 180 aa  90.1  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 199 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 186 aa  89  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 197 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 185 aa  87.4  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046251 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 200 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 201 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 196 aa  86.3  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 198 aa  86.7  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5341  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 194 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4799  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 195 aa  86.7  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.914161 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 188 aa  87  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 182 aa  86.7  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 187 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 191 aa  85.5  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.891873 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 193 aa  85.1  5e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 192 aa  85.1  5e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 228 aa  85.1  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 187 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 187 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 		 193 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4813  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 195 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.800631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5405  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 195 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 187 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2057  transcriptional regulator, TetR family  31.38 
 
 		 191 aa  83.6  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 198 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5456  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.31437 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  34.21 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  31.47 
 
 		 193 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 199 aa  79.3  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2441  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 193 aa  79.3  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.264842  normal  0.509096 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 		 193 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 189 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1404  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4903  putative TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021531  normal  0.0222673 
 
 
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NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.93886 
 
 
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NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 198 aa  75.9  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.838213 
 
 
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NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 189 aa  75.1  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 179 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.73 
 
 		 186 aa  73.2  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_2699  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 197 aa  72  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010335  Caul_5110  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009654  Mmwyl1_2897  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010338  Caul_0539  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_1221  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 186 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.342861 
 
 
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NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  29.69 
 
 		 194 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
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NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
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NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
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