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for query gene Avi_0652 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



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PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0652  Transcriptional regulator protein  100 
 
 
196 aa  396  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4587  transcriptional regulator, TetR family  69.54 
 
 
199 aa  278  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.358268  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6328  transcriptional regulator, TetR family  67.01 
 
 
199 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00138827  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0298  TetR family transcriptional regulator  57.92 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2897  TetR family transcriptional regulator  43.62 
 
 
194 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3383  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.606536  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2973  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 
211 aa  97.4  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0965425 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63880  putative transcriptional regulator  37.16 
 
 
186 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1974  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
188 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.36617  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5550  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
190 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1758  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 
189 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.295684  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1617  TetR family transcriptional regulator  36.24 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2643  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
304 aa  89.7  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4037  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
185 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0431559  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2503  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1101  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
188 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205673  normal  0.0164026 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1392  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.637203  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2118  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
216 aa  90.1  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3196  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
293 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.431019  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2556  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 
304 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3634  regulatory protein, TetR  32.78 
 
 
189 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.247606 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
204 aa  85.9  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2526  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 
252 aa  85.1  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.202309 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 
201 aa  85.5  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1766  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
196 aa  85.1  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0390977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2116  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
218 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.332215 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4385  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3096  TetR family transcriptional regulator  31.89 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.631067  normal  0.061558 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 
193 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3303  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
221 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.808306 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
192 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  32.97 
 
 
191 aa  81.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5358  transcriptional regulator, TetR family  32.96 
 
 
196 aa  81.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25838  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3941  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
222 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0303  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 
228 aa  80.5  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.402109  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4582  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278118  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0084  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 
192 aa  79.7  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3577  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.702591  normal  0.678944 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1426  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.620095 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2626  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
199 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28320  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.115035  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
187 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
192 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
196 aa  76.6  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 
193 aa  75.5  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0171  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3184  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 
186 aa  74.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
187 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0741  regulatory protein, TetR  29.05 
 
 
211 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6146  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6204  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
199 aa  72.8  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.308886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0107  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.267531  normal  0.797255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0114  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13405  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5097  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 
199 aa  72  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8534  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
201 aa  72  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2563  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 
192 aa  72  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.227827  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6080  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 
199 aa  72  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1188  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
193 aa  71.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3906  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
189 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0242743  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  30.27 
 
 
195 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1602  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 
191 aa  69.3  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0427  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2017  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
184 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
179 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
193 aa  68.6  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2276  TetR family transcriptional regulator  29 
 
 
182 aa  67.4  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 
203 aa  67.4  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 
196 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3810  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
191 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2719  regulatory protein, TetR  30.71 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111608  normal  0.97579 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  30.85 
 
 
186 aa  65.5  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 
179 aa  65.1  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
179 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2933  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
193 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0101224  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 
179 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0035  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00656395  normal  0.0912126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2347  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 
194 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462347  normal  0.0620265 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4737  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
209 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.838213 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2168  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
188 aa  63.5  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5143  transcriptional regulator  27.59 
 
 
200 aa  63.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.269687  normal  0.0526166 
 
 
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NC_010510  Mrad2831_6000  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.513273  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2480  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3608  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4120  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 
180 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 
180 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0142024 
 
 
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NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 
180 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_6374  putative transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 
191 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.891873 
 
 
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NC_010172  Mext_3797  regulatory protein TetR  28.89 
 
 
180 aa  61.2  0.000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.350305  normal 
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0195  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
194 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.5282  normal  0.427112 
 
 
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NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
179 aa  60.1  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.748169 
 
 
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NC_011663  Sbal223_2172  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 
185 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046251 
 
 
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NC_010625  Bphy_6078  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0977252 
 
 
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