233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_0892 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_0881  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.929355 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0875  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0892  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  399  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.397174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  41.45 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  37.44 
 
 		 220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4813  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 223 aa  117  7.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  37.95 
 
 		 207 aa  114  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0880  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 213 aa  111  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0874  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0891  TetR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 213 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.173189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7134  transcriptional regulator, TetR family  33.66 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0109323  normal  0.572193 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3574  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 215 aa  62  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1967  TetR family transcriptional regulator  20.65 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7959  putative transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 197 aa  58.9  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4778  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0545614  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 199 aa  58.5  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 199 aa  58.2  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0316  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 176 aa  57  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3489  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 193 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  25.7 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  26.7 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2163  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0855716  normal  0.614843 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  30.11 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1453  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 183 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  25.14 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0384  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.422043  normal  0.0982604 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0577  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  20.12 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0809  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 233 aa  51.6  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 203 aa  51.2  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9334  putative transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 193 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.913929  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  26.63 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6049  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2773  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2640  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.308303  normal  0.133482 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 197 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0472  putative transcription regulator protein  28.66 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.19326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0347  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.421077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  22.65 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 199 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0362  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 200 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  24.59 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2749  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.407163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4039  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.105463  normal  0.161647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2110  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2722  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.40024  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  23.46 
 
 		 219 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  23.4 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.46 
 
 		 213 aa  48.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0445  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  22.58 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  24.54 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0660  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 197 aa  47.4  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3230  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 191 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0704446  hitchhiker  0.00000846551 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3520  TetR family transcriptional regulator  26.58 
 
 		 236 aa  46.6  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  21.14 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2877  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.477107  normal  0.116943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1467  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.861342  normal  0.113855 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  23.93 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 192 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  23.38 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0196  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.784528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0694  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.357828  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2749  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2329  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>