More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4304 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  413  9.999999999999999e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  87.24 
 
 		 203 aa  355  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  36.59 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 256 aa  79.7  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 205 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 210 aa  75.1  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 205 aa  72.4  0.000000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 193 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 243 aa  70.9  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3699  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.158617  normal  0.554277 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6095  regulatory protein, TetR  28.06 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.584059  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  26.84 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 223 aa  65.9  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.51 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  31.43 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 212 aa  62.8  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 243 aa  62.8  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 194 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 214 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4091  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0267897 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  34.74 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 246 aa  62  0.000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4581  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 453 aa  62.4  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0520678  hitchhiker  0.00576912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 207 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05345  transcriptional regulator, tetR family protein  25.26 
 
 		 190 aa  61.6  0.000000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  hitchhiker  0.00749651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 		 192 aa  61.6  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  22.11 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 241 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 233 aa  61.2  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 189 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  48.48 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  25.59 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 226 aa  60.5  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0092  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.367108  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0520  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.711752  normal  0.521102 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 224 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  26.9 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1044  TetR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0206033 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 209 aa  58.2  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  34.26 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5925  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 198 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 260 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 307 aa  57  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3998  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000456955  normal  0.178314 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>