More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1602 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1602  transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  418  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0331088  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  28.63 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 211 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  23.58 
 
 		 247 aa  64.7  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 255 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 		 225 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.23 
 
 		 236 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  24.89 
 
 		 260 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 210 aa  62  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  23.83 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  23.08 
 
 		 203 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  22.6 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  22.48 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  22.87 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 246 aa  60.5  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  22.12 
 
 		 247 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  20.52 
 
 		 343 aa  59.3  0.00000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2719  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  22.49 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 278 aa  58.5  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  22.82 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 213 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  23.85 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 265 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  19.35 
 
 		 229 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  25.7 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  23.33 
 
 		 293 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 255 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  26.88 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  20.95 
 
 		 304 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  24.76 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3985  hypothetical protein  22.09 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.997476 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  23.04 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  22.36 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  17.91 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1574  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  24.29 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  24.29 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  24.29 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3861  regulatory protein TetR  29.25 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.153714  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  23.98 
 
 		 248 aa  52.4  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  22.71 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 267 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  29.03 
 
 		 315 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  21.9 
 
 		 241 aa  52  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  24.76 
 
 		 213 aa  52  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5480  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191465 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  21.4 
 
 		 244 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  23.91 
 
 		 281 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 256 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3105  TetR family transcriptional regulator  20.48 
 
 		 260 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  18.91 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  20.87 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  21.43 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 272 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 291 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 227 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  21.96 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  21.57 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 250 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2453  transcriptional regulator, TetR family  24.17 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.106386  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  22.97 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  21.86 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  23.28 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 250 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3567  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0246266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  23.19 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  19.91 
 
 		 235 aa  49.7  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>