More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00128 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  435  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  94.31 
 
 		 211 aa  392  1e-108  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  73.93 
 
 		 242 aa  328  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  56.04 
 
 		 214 aa  243  9.999999999999999e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 215 aa  194  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 218 aa  194  1e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 215 aa  193  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  44.61 
 
 		 217 aa  190  1e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 215 aa  190  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 211 aa  181  6e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  42.23 
 
 		 213 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 225 aa  181  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  40.2 
 
 		 220 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  42.16 
 
 		 215 aa  177  8e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 227 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 221 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 221 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  37.3 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  35.68 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 215 aa  131  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  35.53 
 
 		 220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  34.85 
 
 		 220 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 235 aa  117  9e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 238 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 209 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 236 aa  113  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
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NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  29.38 
 
 		 231 aa  112  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 244 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 251 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 252 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 239 aa  105  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 253 aa  105  4e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 237 aa  102  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 208 aa  99.8  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 222 aa  98.6  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 247 aa  96.7  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 223 aa  91.7  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 220 aa  89.4  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 217 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 204 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 204 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  30.69 
 
 		 205 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 205 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  31.08 
 
 		 204 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  25.39 
 
 		 220 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 220 aa  68.2  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  37.5 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  57.4  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4458  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  37.31 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 226 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  32.5 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 307 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 333 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10920  transcriptional regulator  28.42 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0917166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 206 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0562  transcriptional regulator, TetR family  24.08 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00242532  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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