More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1947 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  400  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  97.46 
 
 		 217 aa  391  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  90.36 
 
 		 212 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  90.36 
 
 		 212 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  90.36 
 
 		 212 aa  367  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  89.34 
 
 		 197 aa  362  1e-99  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  76.26 
 
 		 220 aa  307  5e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  67.01 
 
 		 200 aa  269  2e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  63.4 
 
 		 221 aa  264  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 227 aa  260  1e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3157  TetR family transcriptional regulator  62.89 
 
 		 330 aa  260  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  63.92 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  62.37 
 
 		 226 aa  259  2e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  63.4 
 
 		 215 aa  258  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 216 aa  256  2e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  63.73 
 
 		 220 aa  254  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  61.86 
 
 		 205 aa  252  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  61.03 
 
 		 245 aa  252  3e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  62.37 
 
 		 317 aa  250  8.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  59.9 
 
 		 211 aa  249  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 231 aa  247  9e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 218 aa  244  6.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1050  transcriptional regulator, TetR family  60.51 
 
 		 225 aa  241  3e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.549541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  60.1 
 
 		 199 aa  241  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  59.6 
 
 		 204 aa  240  9e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0994  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 271 aa  240  9e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1944  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 205 aa  237  9e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00538978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  60.1 
 
 		 207 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13360  transcriptional regulator, TetR family  57.58 
 
 		 215 aa  231  4.0000000000000004e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0417905  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1238  AcrR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 273 aa  207  6e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  34.67 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  102  3e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 223 aa  100  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 211 aa  92.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 224 aa  92  5e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 224 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 195 aa  87.8  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 221 aa  86.7  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 275 aa  84.7  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 212 aa  82.8  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 212 aa  82  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 228 aa  81.6  0.000000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 224 aa  79  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 216 aa  77.8  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 220 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 209 aa  77  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 214 aa  77.4  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 222 aa  76.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 205 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06690  transcriptional regulator  30.57 
 
 		 256 aa  76.3  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0305  transcriptional regulator, TetR family  30.32 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.437849  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 206 aa  72  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 220 aa  70.5  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0710  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 248 aa  69.7  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27670  transcriptional regulator  45.83 
 
 		 254 aa  68.9  0.00000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.208365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2242  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 208 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0149249  normal  0.352289 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2486  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00165208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0194  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 225 aa  68.2  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  31.77 
 
 		 218 aa  68.2  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1650  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 196 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00305011  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4626  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 211 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110176  hitchhiker  0.00755279 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38900  transcriptional regulator, TetR family  26.46 
 
 		 226 aa  67  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.749862  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 218 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  28.35 
 
 		 202 aa  65.9  0.0000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 203 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 233 aa  65.1  0.0000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 194 aa  65.1  0.0000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 203 aa  64.7  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  48.28 
 
 		 220 aa  64.7  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2475  transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.260568  hitchhiker  0.0024636 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 210 aa  63.2  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 208 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3981  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000890193 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1434  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.185065  normal  0.789444 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0293  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 230 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3827  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 212 aa  62  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.31638 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 192 aa  62  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4944  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5032  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5325  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.586018  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>