More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0355 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
195 aa  387  1e-107  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
230 aa  79  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  33.81 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1114  TetR family transcriptional regulator  30.29 
 
 
223 aa  76.6  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  45.35 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  44.19 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 
211 aa  74.3  0.0000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2923  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 
196 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.30016e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 
211 aa  72  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2716  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0607966  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2924  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
196 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 
236 aa  71.2  0.000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2963  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.08395  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 
196 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2667  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.182644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0067  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000826521  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 
291 aa  68.2  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
286 aa  67.8  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 
288 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2934  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  25.63 
 
 
194 aa  65.9  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 
310 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1380  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000685689  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 
207 aa  62.4  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  24.52 
 
 
219 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
248 aa  61.2  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 
197 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  30.77 
 
 
208 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2734  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 
225 aa  59.3  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 
206 aa  58.9  0.00000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  23.75 
 
 
219 aa  58.9  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 
287 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  43.75 
 
 
211 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23890  transcriptional regulator  34.15 
 
 
197 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.109769  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  28.16 
 
 
201 aa  57.8  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4395  transcriptional regulator, TetR family  26.23 
 
 
196 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.724029  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1395  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0418723  normal  0.76235 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
225 aa  56.6  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 
237 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
307 aa  57  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 
208 aa  56.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
247 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0969  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0021423 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
255 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 
193 aa  55.5  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1641  transcriptional regulator, TetR family protein  40.54 
 
 
145 aa  55.8  0.0000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.216203  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  25.99 
 
 
205 aa  55.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 
231 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 
188 aa  55.8  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 
200 aa  55.5  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
207 aa  55.5  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
196 aa  55.5  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0496  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
202 aa  55.1  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.250936 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
189 aa  54.7  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  22.02 
 
 
214 aa  54.7  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
240 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4789  transcriptional regulator  31 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
201 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4787  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 
212 aa  53.9  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0422575  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 
189 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0023  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4292  TetR family transcriptional regulator  25.57 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 
194 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
222 aa  53.5  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4190  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 
190 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.74511  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 
290 aa  53.5  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  31.15 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02226  transcriptional regulator, TetR family protein  36.76 
 
 
196 aa  53.1  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.972925  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
291 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
212 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
291 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
290 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
290 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  23.81 
 
 
225 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  35.06 
 
 
186 aa  52.8  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 
212 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 
290 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
290 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0125  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 
204 aa  52.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.247519  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 
208 aa  52.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>